Pháp luật của các nước thường quy định tàu thuyền nước ngoài muốn vào nội thủy của quốc gia ven biển đều phải xin phép. Thời gian, thủ tục xin phép, cơ quan có thẩm quyền cấp phép… do pháp luật quốc gia quy định. Nghĩa vụ xin phép sẽ không đặt ra trong các trường hợp sau:
Thứ nhất, tàu thuyền nước ngoài gặp các sự cố, tai nạn… đe dọa an toàn của con tàu hoặc hành khách, hàng hóa trên tàu. Tuy nhiên, khi đã vào được nội thủy, tàu thuyền nước ngoài phải khẩn trương thông báo cho cơ quan có thẩm quyền của quốc gia ven bờ về sự hiện diện của mình và tuân thủ các quy định, hướng dẫn của cơ quan hữu quan;
Thứ hai, tàu thuyền nước ngoài được quyền đi qua không gây hại tại một số vùng nước thuộc nội thủy nếu những vùng này chỉ trở thành bộ phận của nội thủy do quốc gia ven bờ khi sử dụng phương pháp đường cơ sở thẳng để xác định chiều rộng của lãnh hải đã gộp vào nội thủy.
Quốc gia ven biển thông qua các cơ quan có thẩm quyền có thể quy định các điều kiện cho tàu thuyền muốn nhập cảng, được quyền ngăn chặn các tàu không đủ điều kiện vào nhập cảng, hoặc ngăn chặn tàu rời cảng khi xảy ra vi phạm